高效能成對比對方式，有效評估高效率
COSMOsim3D採用精密的LSP方法來評估分子與模板分子的相似性，讓用戶能夠同時處理不同化學型態的數據集。因此，COSMOsim3D方法適用於具有不同化學型的數據集，讓使用者能夠找到具有相似形狀和極性特徵的替代化學支架。此外，COSMOsim3D亦利用了現今被證明含有相關分子相互作用所需的信息的局部σ分佈，來協助整體比對操作。
完善篩選功能，精準評估不是夢
COSMOsim3D利用多模板對齊方式，對齊多個模板分子並利用它們的疊加作為虛擬模板分子，並用於潛在配體分子的比對和相似性評估。而COSMOsim3D可用於根據其與單個模板的相似性或來自多個配體疊加的虛擬模板對一組潛在的配體分子進行排序。它豐富了具有潛在同源藥物的配體組，減少假陽性的產生，並且更真實更準確的命中評估。
